Η έρευνα ανατέθηκε στο Αστυνομικό Τμήμα Νοτίου Πηλίου, το οποίο καλείται να διερευνήσει τυχόν τέλεση τριών πλημμεληματικών αδικημάτων: παρακώλυση λειτουργίας κοινωφελών εγκαταστάσεων, πρόκληση κοινώς επικίνδυνης βλάβης με πιθανό κίνδυνο για ανθρώπινη ζωή και παράβαση καθήκοντος.
Στο πλαίσιο της διαδικασίας θα εξεταστούν τα αίτια της βλάβης στην κεντρική και μοναδική γεώτρηση που υδροδοτεί τους Αφέτες, καθώς και εάν είχε προηγηθεί η απαιτούμενη συντήρηση. Επίσης, θα ερευνηθούν οι ενέργειες που έγιναν από τη δημοτική κοινότητα, τη δημοτική αρχή αλλά και το συνεργείο αποκατάστασης.
Τέλος, η Εισαγγελία ζήτησε να πραγματοποιηθούν δειγματοληψίες προκειμένου να διαπιστωθεί η ποιότητα του νερού που καταλήγει στις βρύσες, δηλαδή αν είναι πράγματι κατάλληλο για ανθρώπινη κατανάλωση.